她聪明灵巧，又精通文字，被派到内宫书房看守藏书。宪宗偶然一次到内宫藏书处，她被临幸，有了身孕。当时万贵妃受到专宠，骄横善妒，后宫有怀孕的都被她算计堕胎。她知道纪氏怀孕后非常生气，令官婢去给纪氏堕胎。宫婢假称纪氏是害胀气病，这才逃过一劫。后来纪氏被送到安乐堂生下了孝宗。她害怕惹来灾祸，让宦官张敏将他抱走溺死，张敏说：“皇上还没有子嗣，怎么能抛弃他呢？”就把他藏在别室抚养，长到五六岁，还不曾剪胎发。

到了成化十一年（1475），有一天，张敏为宪宗梳头，宪宗对镜长叹：“眼看着老了，还没有儿子啊！”张敏这才告诉他纪氏生子一事，孝宗这时已六岁了。使者去接时，纪氏抱着孝宗大哭说：“儿子离去，我是活不成了。”宪宗见到孩子，悲喜交加，抱着他放在膝上凝视良久，哭着说：“是我的儿子，像我啊。”于是立为皇太子，取名为朱祐樘，封纪氏为淑妃。但过了不久，纪氏就暴病而亡，都传说是万贵妃害死的，宦官张敏也因惧怕万贵妃而吞金自杀。