年嘉靖三十六年葡萄牙殖民者私自扩大在澳门的居住地，筑炮台，建城垣，设官管理。明朝仅向其收取租金。1559年嘉靖三十八年倭寇犯通州、福州、淮安等地。清太祖努尔哈赤生。1561年嘉靖四十年戚继光大破倭寇于台州。1562年嘉靖四十一年浙东倭患平息。倭寇大举侵扰福建，戚继光入闽抗倭。严嵩败，子严世蕃谪戍。重录《永乐大典》。1563年熹靖四十二年俞大猷、戚继光大败倭寇于福建。1564年嘉靖四十三年戚继光破倭于仙游，福建倭患平息。倭犯广东。1565年嘉靖四十四年戚继光、俞大严合歼广东残倭，沿海倭乱基本平定。严世蕃伏诛。1566年嘉靖四十五年世宗卒，子裕王朱载后继位，是为穆宗。海瑞上《治安疏》。1567年隆庆元年张居正入阁预机务。俺答犯大同，掠交城、文水。鞑靼土蛮部犯蓟镇，掠昌黎、卢龙、滦河，京师成严。调谭纶、戚继光北上防边。1570年隆庆四年俺答孙把汉那吉降明。俺答遣使请封贡。1571年隆庆五年明朝封俺答为顺义王，开设贡市，北面及西北边境暂宁。1572年隆庆六年稳宗卒，皇太子朱翊钧继位，是为神宗。高拱罢，张居正晋升为内阁首辅。1575年万历三年黄河决高邮、砀山。西班牙殖民者自马尼拉来中国，袭用吕宋名号与中国通商。1576年万历四年黄河决崔镇。1577年万历五年张居正丁父忧，“夺情”留位，朝臣有纠劾者多被杖责，谪戍1578年万历六年张居正起用潘季训治河。丈量天下田亩，限三载竣事。李明珍《本草纲目》修成。1580年万历八年黄、淮二河治理工程完成。耶稣会士、意大利人罗明坚到扬州。1581年万历九年裁各省冗官，核徭赋，汰诸司冒滥冗费。通令全国行“一条鞭法”。1582年万历十年张居正卒。耶稣会士，意大利人利玛窦到中国，吴承恩卒。1583年万历十一年追夺张居正官阶。凡张居正所举用的官员，斥削殆尽。努尔哈赤以父祖仇起兵攻尼堪外兰。明使努尔哈赤袭都指挥使。1584年万历十二年籍没张居正家，榜其罪于天下，家属戌边。1585年万历十三年四川建武所兵变。海瑞复官。1588年万历十六年努尔哈赤统一建州五部。1589年万历十七年刘汝国在太湖等地起义，遭镇压，失败。自过年始，神宗不上朝。明朝晋封努尔哈赤为都督佥事。1590年万历十八年群臣请立太子，“争国本”事起。1592年万历二十年宁夏致仁副总兵哮拜反，讨平之，倭寇朝鲜，兵部右侍郎宋应昌经略备倭军务，李如松为总兵官，率兵援朝鲜。1593年万历二十一年李如松战倭于明鲜平壤，克之；进攻王京，败于碧蹄馆，倭弃王京遁。召宋应昌、李如松还。努尔哈赤击败叶赫等九部联军。李时珍卒。1594年万历二十二年山东、河南、徐、淮等地遭灾人民纷纷起义。1595年万历二十三年明朝封努尔哈赤为龙虎将军。明遣使往日本，封平秀吉为日本国王。1596年万历二十四年遗宦官分赴各地开矿、榷税。平秀吉不受封，复侵朝鲜。1597年万历二十五年任麻贵为总兵、杨镐为经略、邢玢为总督，援朝抗倭。四川亳州宣慰司使杨应龙反，掠合江、綦江。1598年万历二十六年援朝诸将败倭，朝鲜平。1599年万历二十七年临清民变，焚税使马堂官署。杀其参随三十四人。武昌、汉阳民变，击伤税使陈奉。杨应龙陷綦江。1600年万历二十八年李化龙率师讨杨应龙。杨应龙自缢死，播州平。两备各省灾伤、饥荒，人民起义。意大利耶稣会士利玛窦至京献方物。1601年万历二十九年武昌民变，杀税监陈奉之参随多人，焚巡抚公署。苏州民变，杀织造中官孙隆之参随数人。立朱常洛为太子。1602年万历三十年腾越民主，杀税监委官。思想家李贽自刎。1603年万历三十一年努尔哈赤统领部下自呼兰哈达移居赫图阿拉。1605年万历三十三年诏罢天下开矿，以税务归有司。1606年万历三十四年云南人民杀税监杨荣。1610年万历三十八年西方历法始入中国。《金瓶梅》问世。1615年万历四十三年“梃击案”发生。1616年万历四十四年努尔哈赤即汗位于赫图阿拉，建元天命，国号“大金”。戏曲家汤显祖卒。1618年万历四十六年努尔哈赤以七大恨告天，誓师伐明，攻占抚顺、清河堡。明任杨镐为辽东经略，加派“辽饷”。1619年万历四十七年发生萨尔浒战役，杜松、刘铤战死，明军大败。后金兵克太原，马林败没。熊廷弼经略辽东，杨镐下狱。再