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成祖早年以燕王封藩于北平,又从北平起兵夺得帝位,即位后改北平为北京,并在北京设立行在六部(以朝廷建制,在北京创建五府六部等官署,称为“行在”)。永乐四年(1406),诏建北京宫殿。永乐七年以后,成祖多次北巡,长期住在北京,而以太子监国南京,天下奏章都要送往北京行在所,北京已经成为实际的政治中心。十四年,成祖又下令营建北京宫殿。十八年,北京宫殿落成。这年九月,成祖下令以北京为京师,正式迁都。
成祖迁都北京,最重要的是出于政治上的考虑,是为了“君主华夷”,“控四夷,制天下”。北京即元朝首都大都。大都作为全国的政治中心,使漠北与中原地区统一在一个政治中心之下,历史上中原政权为北方少数民族困扰的局面在元朝不复存在,元朝创建的是一个真正的华裔一体、四海浑一的国家。早在太祖洪武年间,朱元璋就看到了这一点,有将国都北迁之意,曾派太子朱标巡视河洛和关中。但朱标返回后不久病死,而朱元璋也已年老,迁都之事暂时搁置。成祖迁都北京,肯定了北京作为全国统治中心的地位。再从明朝初期北方蒙古贵族不断南下骚扰的政治军事形势来看,为了有效地抵御蒙古贵族的进犯,将北京作为国都也比南京更为适宜。